Munnskyllevann som inneholder fluor brukes for å unngå hull i tennene.

Munnskyllevann som inneholder desinfiserende middel, som for eksempel klorhexidin, kan brukes i korte perioder ved infeksjoner i munnen.

Noen munnskyllevæsker inneholder sink og kan være med på å motvirke dårlig ånde og suget etter søtsaker.